ญี่ปุ่นตกอยู่ในความตื่นตระหนกหลังจากเรือหลายลำจมใกล้เกาะโอโดะ ในไม่ช้า คณะสำรวจที่นำโดยดร.เยมานีก็ค้นพบบางสิ่งที่ร้ายแรงเกินกว่าจะจินตนาการได้ ในรูปของสัตว์ประหลาดสูง 50 เมตร ซึ่งคนพื้นเมืองเรียกว่าโกจิรา ตอนนี้สัตว์ประหลาดเริ่มออกอาละวาดซึ่งขู่ว่าจะทำลายไม่เพียงแต่ญี่ปุ่นเท่านั้น แต่ยังรวมถึงส่วนอื่นๆ ของโลกด้วย
